要彻底清除Safari浏览器中网站的历史记录，可以按照以下步骤操作：
1. 打开Safari浏览器。
2. 在地址栏输入你想要清除历史记录的网站URL。
3. 按回车键进入该网站。
4. 点击屏幕右上角的“更多”按钮（一个带有三个点的形状）。
5. 在下拉菜单中选择“清除浏览数据”。
6. 在弹出的窗口中，选择“全部网站数据”，然后点击“清除数据”。
7. 确认你的选择，然后点击“清除数据”。
8. 等待一段时间，直到所有数据都被清除。
这样，你就可以彻底清除Safari浏览器中网站的历史记录了。